Conference GERLI 2024

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Conférence à l’IUEM (PNBI) du 23 au 26 septembre 2024

Le GERLI

Le Groupe d’Etude et de Recherche en Lipidomique (GERLI) est une société savante avec un bureau et un conseil scientifique.

Elle a été créée en 1978 et fait partie des groupes thématiques de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire (SFBBM) qui compte de nombreux groupes thématiques. Au niveau européen, le GERLI est associé à EURO FED LIPID, fédération européenne pour la science et la technologie des lipides. Le GERLI a été depuis 40 ans un moteur dans l’animation scientifique en organisant chaque année un Congrès, et en stimulant l’intérêt des jeunes scientifiques par l’attribution de Prix de Thèse. Les congrès de Lipidomique, avec des thématiques transversales, depuis les aspects très fondamentaux vers l’implication physiopathologique des molécules lipidiques, ont réuni plus de 2000 personnes depuis 2003. Ceci a permis de constituer un réseau de scientifiques dans le domaine.

Conférence 2024

Bienvenue à la 19e réunion du GERLI sur la lipidomique ! Cet événement très attendu réunira des chercheurs de premier plan pour discuter des dernières avancées dans la compréhension de la structure et des fonctions des lipides chez divers organismes vivant dans des environnements aquatiques et terrestres.

Au cours de la réunion, de nouveaux outils et techniques issus de disciplines telles que la biochimie, la biologie cellulaire, la physiologie, l’écologie, la génomique, la protéomique et la lipidomique seront présentés. Ces approches de pointe permettront d’éclairer des questions cruciales concernant la diversité, les fonctions et le métabolisme des lipides, ainsi que leur valorisation industrielle.
A cette fin, 7 sessions seront proposées, allant de la description de la structure des molécules à la définition de leur rôle dans la physiologie des organismes, jusqu’à leur utilisation pour nourrir les populations. Les sessions porteront également sur les techniques analytiques de préservation et de traçabilité, ainsi que sur les techniques émergentes de fluxomique.

La réunion aura lieu du 23 au 26 septembre 2024 à l’Institut Européen des Sciences de la Mer à Plouzané près de Brest et est organisée conjointement par l’Université de Bretagne Occidentale, l’IRD, le CNRS et l’Ifremer.

L’inscription à l’événement comprend l’accès aux sessions scientifiques, aux déjeuners et au dîner de gala. Le nombre de places étant limité (150 participants), nous vous encourageons à soumettre votre résumé dès que possible afin de garantir votre place.

Conformément à notre engagement en faveur du développement durable, nous ferons tout notre possible pour que le congrès intègre des aspects numériques, une restauration et des transports durables.

Nous attendons avec impatience votre participation et nous réjouissons de vous accueillir à Brest en septembre !

7 sessions


  • Session 1 : Structural diversity of lipids from summits to deep sea
  • Session 2 : Roles/functions of lipids and derivatives
  • Session 3 : Lipid markers in trophic ecology : promises and dead ends
  • Session 4: Lipids in their socio-economic context and legal boundaries
  • Session 5: Environmental/climatic and supply issues of omega 3
  • Session 6: GERLI/SFN: Marine lipids and nutrition
  • Session 7 : New progress in lipid methodology

Venez nombreux profiter de la pointe bretonne

La 19e conférence du GERLI aura lieu à L’IUEM, du 23 au 26 septembre 2024. L’IUEM est situé au Technopôle Brest-Iroise à Plouzané, aux portes de la ville de Brest.

Brest est une métropole de 400 000 habitants, zone touristique autant que bassin de vie. De nombreux hôtels allant de 1 à 4 étoiles sont situés dans Brest avec des prix allant de 50 € à 150 € par nuit. Des chambres pour les étudiants sont également disponibles dans le centre de Brest à 10 min en tramway de Brest Arena. La ville et sa périphérie possèdent de nombreux équipements et points d’intérêt attractifs, tels que Océanopolis, les Ateliers des Capucins reliés au centre-ville par le premier téléphérique urbain de France, le Conservatoire botanique National de Brest. La ville a été récemment classée ” Ville d’art et d’histoire “. Innovante et ouverte sur le monde, Brest se distingue des autres villes françaises par ses liens avec le milieu marin, ainsi que par son secteur des sciences et technologies marines de pointe. C’est d’ailleurs du port de Brest que sont partis de grands explorateurs à la découverte de nouveaux mondes : La Pérouse, Kerguelen, Bougainville… Brest a une gare TGV en centre-ville et est doté d’un aéroport international proche du centre-ville, avec un service de navette et de tramway. L’aéroport international de Brest Bretagne propose quelques vols internationaux et un large choix de vols via Paris (Orly ou Charles de Gaulle).

  • (C) Sébastien HERVE

  • (C) Mathieu Le Gall

  • ©Jean-Yves Guillaume

  • Frédéric Le Mouillour/Brest métropole océane

  • (C) Martin Viezzer

Live twitch du master Biologie : le 8 mars dès 18h

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Le Master SML Biologie s’adresse aux étudiant(e)s motivé(e)s par les questions relatives à la biologie et l’écologie marine (parcours Sciences Biologiques Marines) et à la gestion des ressources halieutiques et aquacoles (parcours Sciences Halieutiques et Aquacoles). Afin de présenter plus en détails cette formation, Grégory Charrier, responsable du Master SML Biologie, propose une session live sur Twitch le vendredi 8 mars à partir de 18h.

Lien : https://www.twitch.tv/gregcharrier

La première partie de cette session live sera axée sur la présentation de la structure, des objectifs et du contenu du Master SML Biologie. La seconde partie sera orientée sur les modalités de candidature pour accéder à cette formation, et sur les critères de sélection.

Yvan Pailler, Professeur UBO en Archéologie des sociétés littorales au LETG-Brest

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Que faisais-tu avant de venir à l’IUEM ?

J’ai réalisé ma thèse au Centre de recherche bretonne et celtique (CRBC) à Brest sur la transition entre le monde des derniers chasseurs-cueilleurs mésolithiques et des premiers éleveurs-agriculteurs néolithiques, soit entre 6000 et 3500 av. J.-C, sous la direction de Pierre Gouletquer. Après la soutenance, Alison Sheridan m’a proposé un post doc à Edimbourg en Écosse au National Museum of Scotland. J’y ai travaillé notamment sur l’apparition du Néolithique dans les îles britanniques et l’Irlande qui questionne vraiment puisque la néolithisation de la Grande-Bretagne s’est produite près de 800 ans après celle du continent. Dans ce cadre, je me suis intéressé aux lames polies socialement valorisées, communément appelées « haches polies » ; une partie d’entre elles étaient en jades d’origine alpine. Dans la continuité de ce travail, Pierre Pétrequin m’a embauché sur l’ANR Jade pour poursuivre cette étude à l’échelle européenne en incluant les phénomènes d’imitation par des ateliers locaux à des échelles régionales. Les jades alpins ont été diffusés depuis l’Italie (Monte Viso, Monte Beigua) sur des distances considérables dans toute l’Europe au Ve millénaire, de la Bulgarie à l’Irlande et de la Scandinavie à la pointe italienne (le documentaire). En 2010, j’ai été recruté à l’Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP) à Tours comme responsable de recherches archéologiques, spécialiste du Néolithique. J’ai coordonné plusieurs chantiers de fouilles dans le Centre de la France. En 2013, j’ai obtenu ma mutation en Bretagne, ce qui m’a permis de me rapprocher des collègues de l’UBO, géographes, géologues, biologistes, avec qui j’avais noué des liens dans le cadre des recherches menées parallèlement à ma thèse dans l’archipel de Molène et en particulier sur la fouille de l’habitat Bronze ancien de Beg ar Loued (petit documentaire). Début 2020, l’INRAP m’a mis à disposition de l’Université de Bretagne Occidentale (UBO) sur la Chaire ArMeRIE (Archéologie maritime et recherche interdisciplinaire environnementale) et, en 2023, j’ai été recruté sur une chaire de professeur junior (CPJ) à l’UBO.

Pourquoi as-tu choisi l’IUEM ?

Depuis les années 2000, dans le cadre du programme archéologique molénais, nous avons mis en place une collaboration interdisciplinaire composée de plusieurs chercheurs de laboratoires brestois, et en particulier de l’IUEM. C’est ce noyau de chercheurs qui constituera plus tard l’équipe d’ArMeRIE. C’est donc assez naturellement et grâce au soutien de certains collègues qui voyaient l’intérêt d’avoir une approche interdisciplinaire sur le temps long que j’ai intégré l’IUEM.

Que fais-tu à l’IUEM ?

Mon activité de terrain tourne principalement depuis 3 ans autour de deux fouilles programmées, que je mène avec mon collègue Clément Nicolas du Laboratoire « Trajectoires. De la sédentarisation à l’état » à l’Université de Paris 1 Panthéon-Sorbonne : Porz ar Puns à Béniguet en partenariat avec l’Office Français de la Biodiversité (OFB) et celle de Saint Bélec à Leuhan. Les étudiants de l’UBO issus de disciplines variées (biologie marine, géographie, géologie, histoire, ethnologie) y sont fortement impliqués depuis leur démarrage. Plusieurs de ces fouilleurs réalisent aujourd’hui des masters sur des objets archéologiques ou des écofacts issus de la fouille de Béniguet qui est le chantier école de l’UBO.

Depuis le 1er octobre 2023, j’occupe une chaire de professeur junior qui vise à mieux comprendre les sociétés littorales atlantiques passées, et en particulier les relations et adaptations à leurs milieux. Les fouilles font partie intégrante de cette mission car à Béniguet on explore plusieurs occupations humaines superposées dans la dune à la manière d’un mille-feuille. Grâce à l’étude de leurs dépotoirs (amas coquilliers ou shell middens), nous comprenons la manière dont ces individus vivaient et exploitaient leur milieu. Nous apprenons aussi beaucoup sur les phénomènes climatiques passés ; les sociétés insulaires passées ont dû faire face à des épisodes d’ensablement très rapides, ce qui les a forcées à adapter leurs pratiques agricoles, à se déplacer physiquement sur l’île elle-même, dans l’archipel voire à se replier sur le continent. Cela permet de faire le lien avec les bouleversements que nous vivons actuellement. L’adaptation était plus importante à cette époque… À Béniguet, nous avons découvert des sillons d’araires croisés qui datent du Bronze ancien, autour de 2000 avant J.-C. La présence de ces traces indique l’utilisation de l’outil araire (2ème révolution néolithique qui implique la traction animale avec deux bœufs). Les bœufs doivent être nourris toute l’année, il faut donc de gros stocks de nourriture. Avec ce travail archéologique interdisciplinaire, nous arrivons à aller au plus proche du fonctionnement de ces sociétés littorales mais également à comprendre des environnements, des milieux et éventuellement le climat avec lesquels les groupes humains interagissaient.

J’enseigne aussi dans différentes composantes de l’UBO, de la licence au Master à la fois à la Faculté des lettres Segalen avec les masters d’histoire, en histoire de l’art archéologique à Quimper et en biologie marine à l’IUEM dans l’UE paléoécologie et paléoenvironnement du Master de biologie.

As-tu des anecdotes professionnelles à nous raconter ?

Pleins… mais je préfère les raconter en soirée ;).

L’été dernier, lors des fouilles sur Béniguet, nous avons dû aller faire le plein de carburant pour l’Hésione et un peu de ravitaillement. Après avoir regardé la météo, nous constatons qu’un grain s’annonce en début de soirée. La mer étant belle, nous partons en milieu d’après-midi direction Le Conquet où on nous avait dit que l’on trouverait de l’essence. Pas de chance, le Capitaine du Port nous annonce qu’il n’a que du diesel. Avec le collègue, nous faisons donc route vers Camaret où se trouve la pompe la plus proche. On arrive sans encombre en presqu’île où nous faisons le plein et nos courses, mais tout cela prend un peu de temps… Lorsque nous remontons à bord, le ciel s’assombrit sur l’archipel. À mi-route, nous nous retrouvons sous des trombes d’eau et dans une purée de pois, avec une mer formée, à tel point que l’on ne pouvait plus lire le GPS de bord. Bref, n’étant pas de grands marins, on ralentit fortement et on avance à vue pendant ce qui nous semblé être une éternité ; on n’en menait vraiment pas large ! On distingue une première balise « Les Vieux Moines », puis une seconde « Ar Christian Braz » et enfin, on discerne au raz de l’eau la masse de Béniguet, qui n’a jamais aussi bien porté son nom (île bénie). On arrive à la ferme de l’île trempés comme des soupes alors que tout le monde nous attend bien tranquillement auprès d’un feu de cheminée pour prendre un ti-punch bien mérité.

Quel est ton plus beau souvenir de boulot ?

Un souvenir bien vivace reste la découverte d’un atelier de fabrication de lames en jade sur une ligne de crête à 2500 m d’altitude avec P. et A.-M. Pétrequin dans les Alpes italiennes. En effet, avant de faire cette découverte, il avait fallu crapahuter plusieurs jours en montagne sans rien trouver. En prospection, il y a un côté évident, immédiat, de la découverte mais en fouille cela peut prendre plus de temps même si un objet particulier peut apparaître à tout moment sous la truelle. Par exemple, à Beg ar Loued, il nous aura fallu plusieurs années pour dégager et comprendre la manière dont s’organisaient les deux maisons Bronze ancien superposées. Mettre en évidence ce genre de monument avec les murs encore en élévation permet de se plonger plus aisément dans la vie des gens de l’époque. Faire sortir de sa gangue de terre ou de sable une maison ou une tombe d’il y a plusieurs millénaires est quelque chose de vraiment émouvant. Évidemment, les missions passées sur le terrain avec des collègues et des étudiants sont toujours des moments forts surtout lorsque l’on reste un mois sur une île déserte, sans eau et sans électricité…

Quels sont tes centres d’intérêt ?

J’aime être sur l’eau, l’écologie, le swamp rock et le blues, faire du kayak, la pêche (à pied, à la ligne, pose de casiers), la randonnée, je suis aussi un grand lecteur de polars (petit conseil lecture : « un dernier ballon pour la route »).

As-tu une devise ?

Plus j’en sais, moins j’en sais.

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Manon Mabo

UBO

Contact

Yvan Pailler / UBO

WGFAST, Working Group on Fisheries Acoustics, Science and Technology

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Conférence à l’IUEM du 9 au 12 avril 2024

Date limite pour l’inscription et la soumission des résumés : 15 Mars 2024

Le groupe d’experts de ICES/CIEM sur l’acoustique, la science et la technologie des pêches (WGFAST) possède une expertise de pointe dans tous les aspects de l’évaluation des stocks de poissons et de l’estimation d’indicateurs essentiels à la gestion des pélagiques. Il développe également des approches essentielles pour l’approche écosystémique de la connaissance et de la gestion de l’environnement, grâce à : la diversité des plateformes sur lesquelles l’acoustique peut être déployée ; la gamme des organismes qui peuvent être détectés et reconnus (zooplancton, micronecton, poissons, mammifères marins, …) ; la haute résolution de l’information, permettant d’analyser les interactions avec les paramètres environnementaux ; la qualité non-destructive de l’approche applicable aux zones protégées.

Il sera structuré par trois sessions :

  • Méthodes acoustiques pour caractériser les populations, les écosystèmes, l’habitat et le comportement
  • Caractérisation acoustique des organismes marins
  • Technologies, méthodologies et protocoles émergents

Les approches de suivi des zones d’industrialisation de la mer, telles que les parcs éoliens offshore, sont les bienvenues.


3 sessions


Session 1

Caractérisation acoustique des organismes marins


Cette session porte principalement sur la modélisation de la diffusion des organismes et sur la classification/caractérisation des organismes à partir de différents types de données acoustiques (multifréquence, large bande…).


Session 2

Méthodes acoustiques pour caractériser les populations, les écosystèmes, l’habitat et le comportement


Dans cette session, les thèmes principaux couvrent les travaux sur les différentes méthodologies (analyse des données acoustiques, approches statistiques et de modélisation…) et/ou outils (plateformes, technologies combinées…) utilisés pour étudier les prédateurs/proies et les interactions bio-physiques à différents niveaux trophiques et échelles, l’effet de la topographie et du type de fond sur la biologie, les outils d’échantillonnage et les effets sur le comportement…


Session 3

Technologies, méthodologies et protocoles émergents


Dans cette session, les principaux sujets abordés sont les nouvelles plates-formes (planeurs, navires de surface sans équipage…) pour la collecte de données acoustiques, les méthodes issues de domaines non acoustiques comme échantillonnage complémentaire pour une meilleure interprétation des données, les défis pour les nouveaux dispositifs acoustiques, les nouvelles applications…

Venez nombreux profiter de la pointe bretonne

La conférence du WGFAST aura lieu à L’IUEM, du 9 au 12 avril 2024. L’IUEM et situé au Technopôle Brest-Iroise à Plouzané, aux portes de la ville de Brest. Le transport sera organisé du centre ville de Brest à Plouzané chaque jour pour l’aller et le retour.

Brest est une métropole de 400 000 habitants, zone touristique autant que bassin de vie. De nombreux hôtels allant de 1 à 4 étoiles sont situés dans Brest avec des prix allant de 50 € à 150 € par nuit. Des chambres pour les étudiants sont également disponibles dans le centre de Brest à 10 min en tramway de Brest Arena. La ville et sa périphérie possèdent de nombreux équipements et points d’intérêt attractifs, tels que Océanopolis, les Ateliers des Capucins reliés au centre-ville par le premier téléphérique urbain de France, le Conservatoire botanique National de Brest. La ville a été récemment classée ” Ville d’art et d’histoire “. Innovante et ouverte sur le monde, Brest se distingue des autres villes françaises par ses liens avec le milieu marin, ainsi que par son secteur des sciences et technologies marines de pointe. C’est d’ailleurs du port de Brest que sont partis de grands explorateurs à la découverte de nouveaux mondes : La Pérouse, Kerguelen, Bougainville… Brest a une gare TGV en centre-ville et est doté d’un aéroport international proche du centre-ville, avec un service de navette et de tramway. L’aéroport international de Brest Bretagne propose quelques vols internationaux et un large choix de vols via Paris (Orly ou Charles de Gaulle).

  • (C) Martin Viezzer

  • (C) Mathieu Le Gall

  • ©Jean-Yves Guillaume

  • Frédéric Le Mouillour/Brest métropole océane

  • (C) Sébastien HERVE

Projets Interdisciplinaires Mutualisés (PIM) des Masters organisés par ISblue

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La 3ème édition des PIM (Projets Interdisciplinaires Mutualisés) organisés par ISblue a eu lieu du 8 au 12 janvier 2024. Treize projets différents étaient proposés à 200 étudiant·es de l’UBO, de l’UBS et de l’ENSTA Bretagne.

Avec ce nouveau format de cours transversal, ISblue veut éveiller la curiosité des étudiants pour des sujets nouveaux et les préparer aux enjeux de la transition écologique.
Voici quelques exemples d’ateliers proposés aux étudiants :
  • Atelier “CLIMAT : “Imaginer le territoire de Brest Métropole neutre en carbone en 2050″: À quoi ressemblerait le territoire de Brest Métropole en 2050 selon chacun de ces 4 scénarios ?” Les étudiants ont dû imaginer, grâce à un travail collectif de prospective dans les domaines des énergies, de l’alimentation, des mobilités et de l’habitat. Avec Anne-Marie Tréguier, coauteur d’un rapport du GIEC, en partenariat avec l’ADEME et Brest Métropole.

Légende : PIM DESSA – création d’une exposition street art pour explorer les grands fonds marins

  • Atelier “DESSA : Créer une exposition street art pour explorer les grands fonds marins”- Accompagnés par l’artiste Teuthis, les étudiants ont imaginé et conçu une exposition de collages de dessins géants représentant des espèces, des paysages et des outils d’exploration des abysses. Pour les inspirer, des chercheurs de différentes disciplines sont venus leur présenter, au cours de la semaine, des grands sujets de recherche actuels sur les grands fonds marins. Avec des chercheurs de l’Ifremer.
  • Atelier “MICRO-Océan : Créer une exposition artistique sur le microcosme marin” – Les étudiants ont plongé dans le monde mystérieux du microcosme marin au cours d’un workshop arts et sciences guidé par l’artiste Iglika Christova. Après avoir prélevé des échantillons biologiques sur le terrain et les avoir observés en laboratoire, ils ont réalisé des expérimentations plastiques et/ou graphiques qui les ont menées collectivement à la construction d’une exposition. En partenariat avec le festival RESSAC, UBO.

Légende : PIM MICRO-OCEAN – préparation d’une expo sur le microcosme marin

  • Atelier “ÉCLAT-OI : Développer des projets à impacts positifs grâce au Design Thinking et son approche collaborative” – Les étudiants ont embarqué pour une formation intensive de 5 jours sur le Design Thinking, une aventure qui les a plongés au cœur de l’intelligence collective, de la créativité et du prototypage. L’UBO Open Factory (laboratoire d’innovation multidisciplinaire de l’UBO), leur a permis d’explorer les méthodes de conception les plus innovantes tout en abordant une problématique réelle, avec l’association Skravik, qui œuvre pour l’intégration du voilier comme outil de travail polyvalent pour la pêche, la recherche et l’expertise environnementale.
  • Atelier “Enjepol : Partir à la découverte des controverses du monde polaire” – À travers des rencontres avec des chercheurs et professionnels du secteur, cet atelier a proposé de réfléchir aux enjeux polaires en explorant les controverses existant autour des deux régions polaires : ouverture des routes maritimes, eldorados miniers et énergétiques, sanctuarisation scientifique, sensibilisation environnementale et tourisme, militarisation et nucléarisation, enjeux spatiaux, remise en cause des équilibres juridiques et géopolitiques. Avec Anne Choquet, enseignante-chercheure à l’UBO au laboratoire AMURE et présidente du Comité National Français des Recherches Arctiques et Antarctiques (CNFRAA).
Légende de la photo à la Une : PIM OBS-3D – délimitation d’une zone de test pour évaluer la performance de différents protocoles d’acquisition pour un dispositif de photogrammétrie RTK
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Contact

 

SILICAMICS 4 conference

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Date limite pour la soumission des résumés: 16 Avril 2024

Date limite pour l’inscription: 15 Juin 2024

L’inscription et la soumission des résumés est assurée via la plateforme web Scienceconf

La série de conférences SILICAMICS a été lancée en 2015 à l’initiative du groupe international « Silica-group ». Ces conférences visent à développer une approche intégrative et interdisciplinaire qui inclut la chimie, la biogéochimie, la biochimie, la physiologie, la physique et la génomique pour mieux comprendre la biosilicification et les silicifiés dans les océans passés, contemporains et futurs. Parmi les résultats des trois premières conférences SILICAMICS figurent des articles de synthèse dans Nature Geoscience (2018) et dans Biogeosciences (2021) et deux numéros spéciaux de Frontiers in Marine sciences (2019 et 2022) qui ont accueilli plus de 24 articles. La conférence SILICAMICS 4, se tiendra à Brest (France) du 14 au 18 octobre 2024. Elle mettra l’accent sur :

  • Le Cycle biogéochimique du silicium : Processus et flux
  • La Paléo, y compris l’évolution des silicifiés
  • L’Écologie et la biologie des silicificiés marins et terrestres
  • Les Processus de silicification étudiés par des techniques omiques
  • Le Plancton siliceux dans l’océan ouvert : Lien entre la physique et la biologie
  • Les Océans polaires

Construite sur un schéma de type « Gordon conferences », la conférence SILICAMICS 4 réunira un petit groupe d’experts, de jeunes chercheurs et d’étudiants dans un lieu isolé et magnifique proche de Brest. Le comité d’organisation a invité des orateurs de premier plan et les temps de discussions et d’échange entre les sessions de posters et de présentations, ainsi que des groupes de travail offriront aux doctorants et aux jeunes scientifiques la possibilité de débattre avec des scientifiques chevronnés afin de développer leur propre compréhension de la science de façon générale et plus spécifiquement de la thématique phare de SILICAMICS, le cycle du silicium et le rôle des organismes silicifiés dans les océans.

6 sessions, 6 invited speakers

Session 1


Cycle biogéochimique du silicium : processus et flux


Since the end of the previous century, several articles on Si budgets have been published, showing real progress in our understanding of the geochemical and biogeochemical processes that control the Si marine cycle at regional and global scales, and in quantifying the input, output, and biological fluxes at different scales. However, is the marine silica cycle at a steady state, or what are the impacts of global changes on this cycle, are still open questions. In this session, we invite and welcome contributions dealing with processes and Si fluxes that help for a better understanding of the silica cycle at different scales. The invited conference shows how powerful the use of Si isotopes is to understand the surface Earth reactive silica cycle.




Oratrice invitée : Shaily Rahman| Univ. Colorado Boulder, USA

“Probing mass balance, fluxes, and deep time implications of the surface Earth reactive silica cycle using Si isotopes”

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Session 2


Paléo, y compris l’évolution des silicifieurs


In a context of global warming with short meteorological archives (~150 years), reconstructing the dynamics and long-term trends of past climate cycles has never been more relevant. Siliceous microfossils preserve well and offer key information on past environments. Additionally, it is primordial to understand how silicifiers evolved through time for a comprehensive understanding of their systematics and modern ecology. So, in this session we invite and welcome contributions along these lines.  The invited conference will show, based on their assemblages, how siliceous microfossils offer a wealth of information essential to unlock key links between climate and ecosystems.




Orateur invité : Giuseppe Cortese| GNS Science, NZ

“Radiolarians and diatoms as sources of past climate and environmental information in the Southern Ocean”

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Session 3


Écologie et biologie des silicificateurs marins et terrestres


As mentioned by the guest speaker: “all plants accumulate silicon”. All plants, but also animals, from protists to mammals! However, the function of silicon is not always well understood, which prevents us from understanding its possible contribution to the success of certain clades and the expansion of specific biomes. In this session we invite and welcome contributions dealing with the ecological role of silicifiers, the biological benefits and mechanisms of silicification and the relationships with ecosystems. The guest speaker will consider the role of Si in plants from a biome (terrestrial, marine and also freshwater) perspective and will underline the main gaps.




Oratrice invitée : Julia Cooke| The Open University, UK

“Plant silicification by biome”

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Session 4


Processus de silicification et omique


Silicifiers are among the most important living organisms of planet Earth. However, their ability to take up silicic acid and the full processes to precipitate it to build complex silicified architectures remain poorly understood. Diatoms have been the center of attention of bio-silicification studies. The physiology and biochemistry of pelagic diatoms have been extensively studied but many gaps remain regarding the silicification mechanisms and their variations due to environmental changes. Genomics of diatoms and other organisms can help understanding such processes and can be used to formulate new hypotheses and research strategies for explaining the role of different silicifiers in coastal and open ocean ecosystems, and their control of C, N, P, and Si biogeochemical cycles.

In this session we invite and welcome contributions of emerging approaches and other resources that can help us to better understand the silicification processes of all silicifiers. The invited conference will highlight the role of silicon transporter proteins in diatoms.




Orateur invité : Andrew Alverson| Univ. Arkansas, USA

“Gene duplication, shifting selection, and dosage balance of silicon transporter proteins in marine and freshwater diatoms”

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Session 5


Plancton siliceux dans l’océan ouvert : Lien entre la physique et la biologie


Diatoms, which play a key role in the biological carbon pump, are known to thrive in high nutrients – high turbulence systems (cf. coastal upwellings, polar seas, …). In principle, stratified and oligotrophic waters are not favorable for the growth of diatoms. However, it has been shown that episodic blooms of phytoplankton, including diatoms, can occur in specific meso- and sub-mesoscale structures. So far, it has not been possible to link specific dynamical structures to phytoplankton functional types. In this session we invite and welcome contributions that demonstrate the coupling of physics and biology to better understand and model the distribution and production of siliceous plankton in the open ocean. The invited conference gives evidences on how structures with a high degree of coherence in high turbulent kinetic energy and vorticity can sustain high concentrations of diatoms in the sunlit layers.




Orateur invité : Ismaël Hernandez-Carrasco| CSIC, IMEDEA, Spain

“Highly-coherent oceanic structures and their impact on the diatom dynamics”

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Session 6


Mers polaires


In polar environments, diatoms are able to grow in the ice, under the ice, in open waters and at the surface of the sediments. As such, diatoms traditionally dominate the primary production of the polar seas. However, different drivers linked to natural variability and global change already provoke a switch towards non-diatom species such as Phaeocystis or other small flagellates. Moreover, the physiological changes involved in diatoms by global changes suggest potential strong consequences for the future contribution of the high-latitude ecosystems to carbon export and climate mitigation.  Moreover, a shift in rhizarian populations is observed related to global warming. With the increasing melting of the glaciers siliceous sponges are sprouting up. This session invites all works trying to understand the actual contribution of silicifiers and their evolution in the fast-changing polar seas. The invited conference will review the major contribution of diatoms in polar environments.




Oratrice invitée : Karley Campbell | UIT, Norway

“Diatoms in polar seas”

Comité scientifique


  • Su Mei Liu (UOC, China)
  • Patricia Grasse (Center for Integrative Biodiversity, Leipzig, Germany)
  • Manuel Maldonado (CSIC, Spain)
  • Jill Sutton (LEMAR-IUEM)
  • Aude Leynaert (LEMAR-IUEM)
  • Paul Tréguer (LEMAR-IUEM)
  • Brivaela Moriceau (LEMAR-IUEM)
  • Jeff Krause (Univ South Alabama, USA)
  • Xavier Crosta (EPOC, Univ Bordeaux)

  • Taniel Danielan (Univ de Lille)
  • Tristan Biard (LOG, Wimereux)
  • Damien Cardinal (LOCEAN, Sorbonne Université)
  • Johann Lavaud (LEMAR-IUEM)
  • Fabrice Not (SBR-Sorbonne Univ)
  • Matthieu Civel (LEMAR)
  • Lucie Cassarino (LEMAR)
  • Natalia Llopis-Monferrer (MBARI, California)
  • María López Acosta (CSIC IIM, Vigo)
  • Dongdong Zhu (OUC, Qingdao)

Comité d’organisation


  • Jill Sutton (LEMAR, UBO)
  • Brivaela Moriceau (LEMAR, CNRS)
  • Stefan lalonde (Geo-Ocean, CNRS)
  • France Floch (Geo-Ocean, UBO)
  • Olivier Rouxel (Geo-Ocean, IFREMER)
  • Matthieu Civel (LEMAR)
  • Lucie Cassarino (LEMAR)
  • Paul Tréguer (LEMAR, UBO)
  • Aude Leynaert (LEMAR, CNRS)
  • Johann Lavaud (LEMAR)

Lieu de la conférence

L’événement se tiendra en Bretagne (France) à Logonna-Daoulas en octobre 2024 au centre de séminaire “Moulin Mer”. Ce centre offre un espace pour les sessions et les ateliers, les repas et l’hébergement, le tout en un seul lieu, y compris l’accès à des salles pédagogiques et des sites d’échantillonnage dans les environnements marins, d’eau douce et terrestres. Pour votre conjoint, il donne également accès à de belles promenades le long des plages, à la forêt et à des zones d’activités telles que le volley-ball, le badminton, la voile et la pêche. Le site est situé entre Brest et Quimper (8min de l’autoroute). Le site est situé entre Brest et Quimper (8 minutes de la voie rapide). Brest est la ville la plus proche, avec une gare TGV et un aéroport offrant quelques vols internationaux et un large choix de vols via Paris (Orly ou Charles de Gaulle).

Dates importantes et dates limites


Dates d’ouverture des inscriptions et de la soumission de résumés : 24 janvier 2024

Date limite de soumission des résumés : 15 mars 2024 (et lettre d’accompagnement pour l’exemption de frais)

Date limite de sélection des résumés : 15 mai 2024

Date limite d’inscription : 15 juin 2024

Modalités d’inscription


Frais d’inscription (y compris l’hébergement et les repas) :

  • étudiants : 450 euros
  • participants réguliers : 680 euros

Date limite d’inscription : 15 juin 2024

A leur arrivée à l’aéroport ou à la gare de Brest, les participants sont pris en charge et transportés jusqu’au lieu d’accueil de la conférence SILICAMICS.

La soumission des résumés est ouverte


La date limite de soumission est fixée au 16 avril.

Instructions

Pour soumettre un résumé, vous devez créer un compte sur https://silicamics4.sciencesconf.org/

Les soumissions doivent inclure:

  • Titre du résumé
  • Le texte du résumé, limité à 250 mots
  • nom, prénom, adresse électronique et affiliation
  • sélection d’une session scientifique

Pour bénéficier de l’exonération des frais d’inscription, les étudiants doivent soumettre un résumé dans la section “abstract submission” et ajouter une lettre d’accompagnement décrivant leur motivation à participer à Silicamics 4 dans la section “supplementary file” (à la fin du processus de soumission des résumés). Vous êtes néanmoins invités à payer les frais d’inscription qui vous seront remboursés avant la conférence.

L’inscription et la soumission des résumés est assurée via la plateforme web Scienceconf

14 étudiants en Master 2 de Biologie au lycée maritime du Guilvinec

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Dans le cadre de l’UE « médiation scientifique » des Masters en sciences de la mer et du littoral de l’IUEM, quatorze étudiants de M2 Biologie sont allés au lycée maritime du Guilvinec le mercredi 20 décembre 2023.
L’objectif de la journée était d’échanger avec les lycéens et avec les étudiants en BTS. Dans le cadre de ce projet, les étudiant de l’IUEM ont présenté 8 stands sur des thématiques variées en lien avec la recherche en biologie marine. Les stands portaient sur les coraux, l’estran, le milieu polaire, les mangroves, l’écotoxicologie, le plancton, les paléoclimats et l’évolution de la rade de Brest (en lien avec le projet ImmerSeaRade).
Les étudiants de Master ont également eu la chance de découvrir différents aspects de la formation aux métiers de la pêche que suivent les étudiants du lycée du Guilvinec. Les étudiants en BTS leur ont notamment proposé de participer à un atelier de ramendage dans lequel ils leur ont appris à « amarrer des bouts » et leur ont fait tester le simulateur de navigation.
Cette journée très riche a été très appréciée tant par les biologiste que par les lycéens et a contribué à créer des liens entre ces deux mondes très complémentaires que sont le milieu de la recherche
scientifique et de la pêche.
Étudiants ayant participé : Julie Landier, Chloé Jamin, Amandine Bergot, Annaëlle Anquet, Aurore Brossault, Charlotte Gasne-Destaville, Clara Hequette, Elzéar Grassin, Fanny Ferron, Felipe March, Salomé Keromnes, Sid-Amhed Nedjar, Tanguy Genthon et Thomas Le Yannou.

Crédit photos

Lycée maritime du Guilvinec

Maxime Kernec /UBO

Contact

Chloé Jamin / UBO

Lisa Maillard, Future Post doc CNES en interactions air-mer au LOPS

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Que faisais-tu avant de venir à l’IUEM ?

J’ai suivi le master en océanographie Water Air Pollution and Energy, entre l’Université Paris Saclay et Sorbonne Université. C’est grâce à cette formation que j’ai pu participer à la campagne en mer Méditerranée MOOSE-Grande Échelle (MOOSE-GE) qui a lieu tous les ans et qui assure un suivi des masses d’eau et de leur température, salinité… J’ai réalisé mon stage de Master à Ifremer au LOPS, pendant lequel je m’intéressais à la génération des vagues par les cyclones tropicaux. J’ai ensuite fait ma thèse à Toulouse, au laboratoire d’études en géophysique et océanographie spatiales (LEGOS). Pendant ma thèse, j’étudiais des ondes qui se propagent dans l’océan Pacifique, appelées ondes tropicales d’instabilité. À partir de simulations numériques, j’évaluais leur impact sur la circulation océanique et atmosphérique au niveau de la bande tropicale.

Pourquoi as-tu choisi l’IUEM ?

Je souhaitais reprendre mes recherches autour des vagues et de leur génération sous les vents extrêmes. Être dans l’équipe SIAM du LOPS me permet de pouvoir travailler au sein d’une équipe spécialisée dans l’étude des vagues, que ce soit par observation satellite ou par modélisation numérique.  Je suis aussi venue à l’IUEM pour le cadre de vie et pour pouvoir travailler proche de mon sujet d’étude : la mer.

Que fais-tu à l’IUEM ?

Je travaille sur plusieurs projets en tant qu’ingénieure Calcul scientifique Ifremer et je consacre la plupart de mon activité à une nouvelle technique d’observation des vagues par satellite, qui permettrait de mesurer à la fois la hauteur des vagues, leur fréquence et leur direction. Ma mission consiste à valider cette nouvelle technique en la comparant avec d’autres formes d’observation déjà existantes (bouée ou altimètre par exemple).

L’un des autres projets auquel je participe est la mise en place d’une librairie informatique (Python) qui regroupe des outils d’étude des vagues et qui mutualise les codes faits par les chercheurs du laboratoire. Elle sera disponible en Open Source afin d’être accessible à toutes et à tous.

À partir du 1er avril, j’entame un post doc financé par le CNES, toujours au LOPS. Je vais continuer à travailler sur l’étude des vagues mais cette fois-ci je m’intéresserai aux interactions entre les cyclones tropicaux et les vagues qu’ils génèrent.

As-tu des anecdotes professionnelles à nous raconter ?

Durant ma thèse, je suis partie en mission à Hawaii pendant un mois. Le 1er weekend, j’ai décidé d’aller visiter l’île. J’étais sur la côte Nord d’Oahu, quand je suis tombée sur une compétition de surf. Je me suis arrêtée pour regarder car c’était sympa, l’ambiance était bonne. Plus tard, je me suis rendue compte que je venais d’assister à une compétition mondiale de surf avec Kelly Slater, considéré comme le meilleur surfeur de tous les temps.

Quel est ton plus beau souvenir de boulot ?

Pendant ma campagne en mer en Master, nous nous sommes faits encercler par un groupe de globicéphales. C’était très impressionnant et on entendait leur chant dans la coque du bateau, c’était magnifique.

J’aime aussi beaucoup les moments de partage et d’échanges dans le cadre du travail en équipe. Je trouve ça super important et stimulant de travailler à plusieurs et de s’échanger les connaissances.

Quels sont tes centres d’intérêt ?

L’escalade, c’est mon principal centre d’intérêt. Depuis que je suis en Bretagne, j’ai aussi commencé à pratiquer les sports nautiques tels que le surf et la plongée.

Crédit photos

Quentin Guillaumin

Campagne MOOSE-GE

Emma Bent

Contact

Lisa Maillard / Ifremer