Nereis Park VI


The aim of this event is to bring together the international scientific community of researchers working on the mechanisms of bioturbation in marine, freshwater and terrestrial environments, at all latitudes (polar, tropical, temperate), and taking different time scales into account (from Precambrian to present). This event is organized by the Nereis Park association, an international association gathering all scientists working on Bioturbation .

This 6th edition proposes an international thematic school on Bioturbation with conferences and with high-level training with the aim of giving scientists and students the latest conceptual and technological advances on bioturbation processes. This event will concern these processes as a whole and their impacts on ecosystem functioning, at different spatial and time scales.

Opening pre-registration: February 14, 2020


Deadline of submission: April 12, 2020

5 sessions

Session 1: Bioturbation-ecosystem relationships

Keynote lecture: Pr. Murray Gingras | Univ. Alberta, USA

In this session, the role of bioturbation for ecosystem evolution will be discussed with particular focus on the various ecosystem services provided by bioturbation in terrestrial, freshwater and marine ecosystems in the context of global change. The various effects of bioturbation will be addressed including: sediment erosion, stabilization and drainage, biogeomorphology, contaminants and cysts releasing, oxygenation and bioremediation of polluted sediments and soils, organic matter recycling. For the first time in a NP conference, functioning of past and extreme environments (Precambrian, Quaternary caves, mangroves, polar and deep environments, hyper-saline lakes…) will be considered.

Session 2: Integration of bioturbation processes into biodiversity patterns and functions

Keynote lecture: Dr. Andrew M. Lohrer | NIWA, New Zealand

The influence of bioturbation activities on ecosystems depends on benthic structural and functional diversity, strongly linked to environmental variables. This session will address different approaches (i.e., species, functional diversity, biological traits…) for evaluating the effects of biodiversity on ecosystems functioning, through experimental and field studies. This will be the initial statement for an open forum session based on two questions:

  • How do we integrate the role of individual species characteristics on benthic processes at the community scale?
  • How do we upscale the effects of benthic communities at the ecosystem level?

Wiebke Ziebis

Session 3: Micro/macro-organisms interactions for the biogeochemical cycles

Keynote lecture: Dr. Wiebke Ziebis | Univ. Southern Carolina, USA

Bioturbation activities modify microbial diversity and processes involved in the sediment organic matter degradation and recycling. The latter have an influence, at larger scales, on biogeochemical fluxes and budgets (carbon, nitrogen, sulfur, phosphore, silica, iron). Organic matter quality (refractory versus labile) and environmental variables drive the benthic microbial processes. This session will focus on the interactions between the micro-organisms (e.g. procaryotes, cable bacteria, archae, eucaryotes and co-occurrence networks) and macro-organisms involved in sediment biogeochemistry

Session 4: New approaches of observation, analysis and modeling for bioturbation studies

Keynote lecture: Dr. Simone Pennafirme | Univ. Federal do Fluminense, Brazil

This session will focus on the different tools allowing to deal with ecosystem heterogeneity:

  • 2D optical and infrared sensors, to measure micro-heterogeneity of solutes in porewaters (oxygen, manganese, sulfur, CO2, pH…)
  • Biogeochemical fluxes at the sediment-water and sediment-air interfaces
  • Remote sensing to visualize microtopography and benthic diversity at the sediment surface
  • Tomography imaging, to visualize in 3D biological structures within sediments and soils
  • Mechanistic and stochastic models to simulate biogeochemical processes associated to animals behavior.

We will also consider the potential limitations of these tools, and how they can be overcome for specific field study or experimental set up.

Robert Aller

Session 5: Scales transfer

Keynote lecture: Pr. Robert C. Aller | Stony Brook University, USA

Integrating the outcomes of the conference and the wokshops of the thematic school, this session will focus on downscaling and upscaling (scale transfer) referring to:

  • the importance of a specific bioturbation process within diagenetical models;
  • the representation of the species or functional traits in the community;
  • the transfer from controlled experiments to in situ studies integrating the ecosystem as a whole;
  • extrapolation of results obtained from a local study at ecosystem level taking into account its spatial and temporal variability.

Thematic school objective

This event will offer different and complementary tools in each session (courses and case studies as form as keynote lecture and short talks, respectively, practical works in the field and in the lab, open forum session, round tables..) to understand the role of bioturbation in the current and past functioning of ecosystems, and to know how to integrate it into ecosystem models, in ecological engineering and ecosystem restoration / management projects. These scientific and educational meetings, by mixing the disciplines, will thus help to build up a network of expertises. This will bring out innovative approaches to answer fundamental and methodological questions. This event is addressed to any scientist (researcher, student, engineers) as well as manager in environmental science.

International scientific committee

Dr. Stefano Cannicci (University of Hong Kong, China)

Dr. Suzanne Dufour (Memorial University, Canada)

Dr. Stefan Forster (University of Rostock, Germany)

Dr. Franck Gilbert (CNRS | ECOLAB, France)

Dr. Boris Jansen (Amsterdam University, Netherlands)

Dr. Pascal Jouquet (IRD | iEES, France)

Dr. Florian Mermillod-Blondin (CNRS | LEHNA, France)

Dr. Emma Michaud (CNRS | LEMAR, France)

Dr. Thomas Stieglitz (IRD | CEREGE, France)

Dr. Daniella Zeppilli (Ifremer | PDG-REM-EEP-LEP, France)

Local organizing committee

Dr. Emma Michaud (CNRS | LEMAR)

Dr. Gerard Thouzeau (CNRS | LEMAR)

Dr. Olivier Gauthier (Brest University | LEMAR)

Dr. Jill Sutton (Brest University | LEMAR)

Dr. Stefan Lalonde (CNRS | LGO)

Emilie Grosstefan (CNRS | IUEM)

Sébastien Hervé (Brest University | IUEM, LEMAR)

Nadine Reniers (CNRS |IUEM)

Nathalie Le Mentec (Brest University | IUEM, LEMAR)

Supported by


This event will be held in Brittany (France) at Logonna-Daoulas, from the 23rd to the 28th of August 2020, at “Moulin Mer”. This facility provides space for sessions and workshops, meals and accommodations, all at one location, including access to educational rooms and to sampling sites in marine, freshwater and terrestrial environments. For your spouse, it also provides access to nice walks along the beaches, forest, and places for activities such as volley ball, badminton, sailing, and fishing.

The site is located between Brest and Quimper (at 8min from the expressway). Brest is the closest city with a train station (TGV) and an airport offering a handful of international flights and many direct flights from Paris (Orly or CDG).

Abstract call

Each of the five sessions is composed of invited talks, a (limited) set of oral presentations (selected from the abstracts), a poster session, round tables and specific practical and theoretical classes for revised concepts and methods training.

The Scientific Committee of this event invite the participants to submit an abstract in English to one of the following sessions:

  • Session 1: Bioturbation-ecosystem relationships
  • Session 2: Integration of bioturbation processes into biodiversity patterns and functions
  • Session 3: Micro / macro-organisms interactions for the biogeochemical cycles
  • Session 4: New approaches of analysis, observation and modeling for bioturbation studies
  • Session 5: Scales transfer

The preference for oral/poster and the choice of the thematic session are options indicated on the abstract submission form. Motivations and expectations for participating to the thematic school should be added to the pre-registration form.


Deadline of submission: April 12, 2020


Registration fees are free for CNRS staff

The registration is for assisting to the whole sessions successively over the week. This 6th Nereispark event is limited to 70 participants. To participate, fill directly the pre-registration form which includes the abstract submission form (with details on the lay-out of the abstract for a poster or a talk) and a section about your motivations and expectations for participating to the thematic school (with requested administrative informations).

The abstracts will be selected by the international scientific committee. Once your abstract selected, you can fill the final registration form which includes the payment details. Your registration will be official when payment of the registration fee is received.

The conference fee covers the full price of accommodation, food, coffee breaks, and transportation from airport or train station until the conference location, conference and teaching rooms for the thematic school. Choose one option from following arrangements (price per person):

  • [1] Single room = 500 €
  • [2] Shared double room (two beds) = 420 €
  • [3] Student—shared double or triple room (two or three beds) = 370 €

Single rooms are very limited in “Moulin Mer” residence, and in order to accommodate as many participants as possible, most participants will need to share a room. When selecting the “shared room” option, please indicate the name of the participant with whom you’d like as a roommate.

For more informations, send us an email.


Opening pre-registration: February 14, 2020
Deadline of submission: April 12, 2020
Authors notified of abstract selection and program: April 27, 2020
Registration: April 28 – June 1, 2020

Science and Society 2018 at the SML Master’s degree, another success!

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The presentation of the EU “Science and Society” took place on November 13th, and it is (still) a success!

For the launch of this unit, students are divided into 10 teams (all SML disciplines are identified in the teams) according to the topics presented by the doctoral students. Two months of exploration of the subject in an autonomous interdisciplinary team supervised by the doctoral students follow. Many pedagogical objectives are associated with this EU: the exploration of socio-scientific controversies, project-based pedagogy but also scientific mediation for doctoral students on their research subject. Thus, to conclude this reflection, a day of restitution in the form of 1h30 workshops is organized. It is intended for M1 students but also for members of the jury who are teachers, researchers, scientists, communication managers, scientific guides, etc. This day is open to all those curious about multidisciplinary research and scientific mediation.

Mer et Journalisme

Face aux besoins de formation exprimés depuis de nombreuses années par les journalistes sur les sciences et technologies marines, l’Ecole Universitaire de Recherche ISblue propose une école d’été de 2 jours à Brest, au sein de l’Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM). Cette formation destinée aux journalistes francophones des différents médias apporte un éclairage sur plusieurs “points chauds” dans le domaine de la climatologie, l’océanographie, l’économie, le droit et les technologies des sciences marines.

L’école d’été Mer et Journalisme est coordonnée par Paul Tréguer et Pauline Letortu.

Pour vous inscrire :

Sous le parrainage de

Avec la participation de


Laurent Chauvaud (LEMAR | IUEM)
Jean-Pierre Gattuso (LOV | Villefranche-sur-Mer)
Guillaume Roullet (LOPS | IUEM)
Pascale Lherminier (LOPS | IUEM)
Gaël Durand (IGE Grenoble)
Jean Boncoeur (AMURE | IUEM)

Annie Cudennec (AMURE | IUEM)
Gilles Bœuf (MNHN Paris)
Nicolas Kolodziejczyk (LOPS | IUEM)
Jean Tournadre (LOPS | IUEM)
Pierre-Marie Sarradin (EEP | Ifremer)
Catherine Meur-Férec (LETG | IUEM)


Guillaume Roullet (LOPS | IUEM)
Olivier Thébaud (AMURE | IUEM)
Jean-Louis Le Corvoisier
Patrick Poupon (Pôle Mer Bretagne Atlantique)


Laurent Chauvaud

La planète Terre est unique dans notre système solaire. Elle est, dans sa grande majorité, recouverte d’une enveloppe aqueuse : l’océan. L’océan joue un rôle crucial dans les équilibres climatiques et écologiques, mais aussi au niveau économique. Au cours du XXe siècle, pour répondre aux grandes questions sociétales, les sciences et  technologiques marines se sont progressivement structurées en pôles pluridisciplinaires. Après avoir rappelé les principales étapes de la construction d’un pôle mer à vocation européenne et mondiale dans l’ouest de la France, nous illustrerons quelques idées nouvelles qui fleurissent pour orienter les recherches au XXIe siècle.

Jean-Pierre Gattuso

Réchauffement, acidification, désoxygénation, élévation du niveau de la mer : à quoi ressemblera l’océan de l’Anthropocène ? En quoi sera-t-il différent de l’océan du passé géologique de notre planète ? Nous rendra-t-il des services tels que la sécurité alimentaire, la protection des rivages et le tourisme, similaires à ceux qu’il fournit  aujourd’hui ? Quelles solutions peuvent être mises en oeuvre ? Ces questions majeures seront traitées au cours d’un large tour d’horizon qui abordera également les négociations internationales.

Gilles Bœuf

L’océan abrite aujourd’hui un peu moins de 300 000 espèces d’êtres vivants connus, tous groupes confondus, décrits et déposés dans les Musées. Mais on sait bien que l’on est loin du compte, le seul projet «Tara Océans» a ramené 600 000 autres putatifs. Aujourd’hui l’humain tire de l’océan des ressources vivantes, par la pêche et l’aquaculture, mais aussi pour extraire des molécules de haute valeur ajoutée, pour la pharmacologie et la cosmétique. Mais pourrons-nous poursuivre durablement ces activités, car les milieux sont dégradés et pollués, le littoral détruit, le transfert d’espèces invasives généralisé, et la surexploitation banalisée ? Et le climat change trop vite. Alors quelles sont les mesures à prendre pour garder un océan «en bonne santé», garant de notre sécurité future ?

Enjeux thématiques

Les chercheurs qui animent cette formation apportent leur expertise sur des questions scientifiques d’actualité dont les enjeux sociétaux sont majeurs.  L’école d’été est organisée autour de conférences, de tables-rondes et d’ateliers permettant d’échanger entre journalistes et scientifiques.

Enjeux climatiques

Par Pascale Lherminier (LOPS)

L’océan modère fortement les changements climatiques par sa capacité à emmagasiner la chaleur et le CO2. En Atlantique nord, la circulation océanique et les tempêtes favorisent les échanges entre les eaux de surface et les eaux profondes et permettent ainsi l’enfouissement des signaux climatiques en profondeur. Cependant, les modèles climatiques montrent que cette circulation est susceptible de ralentir substantiellement dans le siècle à venir. Pourquoi ? Observe-t-on déjà ce phénomène ? Quelles  seraient les conséquences ?

Par Gaël Durand (IGE7 Grenoble)

Au cours des 20 dernières années, les calottes polaires du Groenland et de l’Antarctique n’ont cessé de perdre de la masse. Elles contribuent maintenant de manière
significative à l’élévation du niveau de la mer et cela se poursuivra très certainement dans un avenir proche. Cependant, l’amplitude de leur contribution future reste incertaine. En particulier, l’Antarctique et Groenland peuvent présenter des processus d’instabilité qui pourraient être déclenchés lorsque les perturbations océaniques ou atmosphériques dépassent un seuil donné. Une fois engagée dans de telles instabilités, la perte de masse s’auto-entretient et de grandes régions pourraient alors s’effondrer. Cette présentation décrira les processus essentiels à l’origine du déséquilibre observé aujourd’hui, nos connaissances actuelles sur les points de bascules potentiels et mettra en évidence les principales raisons des incertitudes sur la projection de la contribution des calottes polaires à l’élévation future du niveau de la mer.

Enjeux économiques et juridiques

Par Jean Boncoeur (AMURE)
Les ressources halieutiques de la planète sont, globalement, de plus en plus surexploitées(FAO, 2018). Les mécanismes endogènes qui expliquent cette situation sont aggravés par des facteurs exogènes, parmi lesquels des politiques publiques inadaptées. La question de la régulation de l’accès est au coeur du problème de l’aménagement des pêcheries. Elle sera illustrée, à titre principal, par des références issues de la politique commune de la pêche et ses déclinaisons nationales.

Par Annie Cudennec (AMURE)

Le rapport IPBES 2019 est particulièrement alarmant : 1 million d’espèces sont menacées d’extinction. Cette menace est particulièrement grave en haute mer et dans les grands marins, car dans ces zones dites internationales, la plupart de la biodiversité ne bénéficie d’aucun statut juridique et peut donc être pillée, dégradée en toute liberté, en toute légalité. Mon exposé aura pour objet, d’une part de présenter les problèmes posés par ce vide juridique et, d’autre part de montrer comment, afin de lutter contre cette situation, des négociations internationales se tiennent actuellement au sein des Nations Unies. Ces négociations devraient aboutir en 2020 à l’adoption d’un accord
international majeur garantissant la conservation et l’utilisation durable de la biodiversité dans les zones hors juridiction nationale.

Enjeux technologiques

Par Nicolas Kolodziejczyk (LOPS)

Depuis le tournant des années 2000, l’observation océanographique connaît une révolution sans précédent. Les nouveaux systèmes d’observation autonomes de l’océan, dont le réseau Argo est l’avatar le plus marquant, permettent pour la première fois d’observer la colonne d’eau de l’océan en temps quasi réel. Cependant l’observation soutenue de l’océan, l’exploration des océans profonds, la pluridisciplinarité des observations (physique, biologique, chimique…), et la masse de données produite par ces nouveaux réseaux restent des défis majeurs pour les océanographes et des enjeux scientifiques essentiels pour comprendre et surveiller l’océan global.

Par Jean Tournadre (LOPS)

La mesure in situ de l’océan est difficile, coûteuse en temps et en matériel et ne peut couvrir que des très petites zones de l’océan. Depuis les années 1980, l’observation
de l’océan repose donc en grande partie sur les mesures par satellite. Celles-ci ne peuvent être que des mesures indirectes des paramètres géophysiques de l’océan et ne concernent que la surface (ou les quelques premiers mètres). Bien que nous ayons une expérience de plusieurs dizaines d’années, certains problèmes de physique de la mesure ne sont toujours pas complètement résolus, en particulier pour la mesure radar de l’océan. En parallèle, l’amélioration des capacités techniques et de traitement informatique fait croître de manière exponentielle la quantité de mesures disponibles et la résolution spatiale des données. Pour les années à venir, une des questions principales sera notre capacité à gérer et à analyser des données de résolution toujours plus élevée dans des bandes de fréquence plus nombreuses et en quantité de plus en plus grande.

Ateliers interactifs

En complément de la formation sur les grands enjeux thématiques, trois ateliers au choix sont proposés :

  • deux ateliers interactifs aborderont d’autres questions d’intérêt sociétal (risques côtiers, deep-sea mining) et prendront la forme d’un exercice de co-construction (scientifiques/journalistes) d’un communiqué de presse ;
  • un troisième atelier concernera l’établissement d’un pré-projet d’e-master “sciences et technologies de la mer” en formation continue pour journalistes. Cet atelier vise à recueillir les besoins de professionnels de l’information.

Deep-sea mining

Risques côtiers

Préprojet d’e-master en formation continue

Frais d’inscription

500 € logement compris ou 300 € sans logement


L’action de formation est éligible à la formation continue :

  • En tant que salarié, vous pouvez compléter une demande de financement auprès de votre employeur. Il est également possible de solliciter l’AFDAS (opérateurs de compétences dont relève la presse écrite et les agences de presse).
  • Enfin, si vous faites le choix de déduire les frais réels, les dépenses de formation professionnelle engagées ont le caractère de frais professionnels.

Pour votre information,  cette formation ne peut pas être prise en charge par le Compte Personnel de Formation (CPF).

N’hésitez pas à contacter Anaëlle LE ROUX pour toutes demandes de renseignements :

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Plus d’informations et inscriptions sur


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