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Séminaire de Philippe Calvez (Institut de Biologie Structurale de Grenoble) le 6 mai 2019

Philippe Calvez, qui vient de terminer un post-doc à l’ Institut de Biologie Structurale à Grenoble sera parmi nous lundi 6 mai 2019 et présentera un séminaire à 11h en Amphi D intitulé :

Membrane : Interplay Between Physics and Biology

ou Coopération des propriétés physiques des membranes dans les processus biologiques

Au niveau cellulaire, les membranes permettent la compartimentation ; elles possèdent donc un rôle structural capital. Par ailleurs, à l’échelle moléculaire, une large gamme de processus biologiques siège au niveau des membranes ; elles assurent donc également un rôle fonctionnel essentiel. D’un côté, les propriétés physiques des membranes ont été largement étudiées, mettant ainsi en évidence l’existence un vaste polymorphisme dans l’organisation des lipides constituant les membranes. D’un autre côté, la biochimie met en évidence la contribution essentielle des lipides dans l’activité des protéines à l’interface membranaire. Pourtant, l’ambivalence structure/fonction des lipides peine à être intégré dans les processus biologiques. Un pas dans ce sens sera présenté durant ce séminaire. Tout d’abord, l’étude biophysique de la recoverine permettra d’illustrer la spécificité de la liaison membranaire des protéines. Puis, à travers l’exemple de Streptococcus pneumoniae, nous montrerons que les propriétés physiques des lipides permettent d’auto-organiser la division cellulaire.

Mots clefs : états physiques des lipides, protéines membranaires, cycle cellulaire.
Techniques : Ellipsométrie, PM-IRRAS, RMN-2D, microscopie de fluorescence.

26/04/2019/by schaal

Séminaire de Vena Haynes (Université du Connecticut, USA) le vendredi 17 mai

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Nous accueillons actuellement au LEMAR Vena Haynes qui réalise sa thèse à l’Université du Connecticut et qui nous présentera ses travaux de recherche portant sur la toxicité des nanoparticules de titane sur les organismes planctoniques le vendredi 17 mai à 11h en A215 (IUEM).

Investigating the phototoxic effects of titanium dioxide nanoparticles on a marine planktonic food web

Résumé

Dans cette présentation, je discuterai de certaines parties de ma recherche de thèse effectuée à l’Université du Connecticut, département des sciences de la mer, et de la recherche collaborative que je ferai ici au LEMAR dans le cadre de ma bourse de recherche Chateaubriand. L’objectif de ma thèse est d’étudier l’impact des nanoparticules de dioxyde de titane (n-TiO2) sur un réseau trophique planctonique marin, dans des conditions similaires à celles que l’on trouve dans la zone photique des eaux côtières. Les nanoparticules de TiO2 se trouvent dans les peintures, les écrans solaires et les produits de soins personnels et pénètrent dans l’environnement marin par les eaux de ruissellement, l’utilisation des produits et les eaux usées industrielles. De plus, le TiO2 est hautement photoactif et génère des espèces réactives d’oxygène (ROS) lorsqu’il est exposé au rayonnement ultraviolet (UV). Il existe certaines preuves de sa phototoxicité pour les organismes aquatiques des systèmes d’eau douce, mais ses effets sur le milieu marin sont mal compris. Cette recherche porte sur les effets du n-TiO2 et de la lumière sur : a) l’abondance et la fonction métabolique des bactéries hétérotrophes et des microalgues associées aux agrégats marins, b) la mortalité, la production d’œufs et le succès d’éclosion du copépode calanoïde Acartia tonsa, et c) la mortalité et la croissance des larves du gastropode (Crepidula fornicata).

18/04/2019/by titodemora

Séminaire de Daniel Conley (Lund University, Sweden) le 29 avril prochain

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Le 29 avril prochain à 10h en salle A215 (IUEM) nous accueillerons Daniel Conley de l’Université de Lund en Suède qui viendra nous présenter ses travaux portant sur le thème suivant:

Constraining variations in the global biogeochemical silica cycle through geologic time.

Résumé de sa présentation :

Il est largement reconnu que l’émergence et l’expansion de la biominéralisation du silicium dans les océans ont affecté la concurrence évolutive pour le Si dissous (DSi). Cela a entraîné des changements dans les cycles biogéochimiques mondiaux du silicium, du carbone (C) et d’autres nutriments qui régulent la productivité des océans et, en fin de compte, le climat. Cependant, une série de découvertes très récentes en géologie et en biologie suggèrent que les premiers impacts biologiques sur le cycle global du Si ont probablement été causés par les procaryotes au cours de l’Archéen avec de nouvelles diminutions du DSi océanique avec l’évolution de la biosilicification du squelette à grande échelle et généralisée, bien avant le modèle actuel. Notre projet entremêle géologie et biologie et créera de nouvelles connaissances sur les interactions entre la biosilicification des organismes et l’environnement et sur la façon dont ces interactions ont évolué au cours de l’histoire de la Terre. Ensemble, ces analyses géologiques et biologiques fourniront de nouvelles perspectives sur les événements clés durant les périodes de réduction du DSi, qui réorganisent la distribution du carbone et des nutriments, modifiant le flux énergétique et la productivité dans les communautés biologiques des anciens océans.

Venez nombreux!

16/04/2019/by titodemora

Séminaire de Christophe Guinet (CEBC, Chizé) le 1er avril à 11h30

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Eléphants de mer bio-échantillonneurs des conditions océanographiques: mesure de nouveaux paramètres océanographiques et évaluation des niveaux biologiques intermédiaires.

Résumé : Ces dernières années les éléphants de mer de Kerguelen sont devenus dans le cadre du Système National d’Observation : Mammifères bio-Echantillonneurs du Milieu Océanique une composante essentielle de l’observation des conditions océanographique du secteur indien de l’Océan Austral. La température, la salinité, et la fluorescence sont maintenant enregistrés en continu et à haute fréquence (0.5 Hz) sur des périodes de plusieurs mois. Plus récemment nos efforts ce sont portés sur l’évaluation de nouveaux paramètres environnementaux. Tout d’abord dans le cadre du post-doctorat de Dorian Cazau à l’ENSTA-B nous avons pu évaluer la force et la direction du vent et l’état de la mer (fréquence et amplitude des vagues) en combinant des mesures acoustique, d’accélération et magnétométrie. Par ailleurs, nos activités de recherche de ces dernières années vise à étudier les niveaux biologiques : phytoplancton aux proies des éléphants de mer en passant par l’évaluation de la distribution et densité des niveaux intermédiaires (zooplancton et micro-necton). Pour cela de nouvelles générations d’enregistreurs ont été développés en partenariat avec le Sea Mammal Research Unit à savoir un micro-échosondeur haute fréquence, faible énergie qui permet de détecter la présence d’organismes biologiques planctonique et micro-nectoniques au cours de la plongée des éléphants de mer. Parallèlement des capteurs de bioluminescence haute sensibilité échantillonnant la lumière à très haute fréquence. Par la mesure simultanée de paramètres océanographiques et biologiques en continu et haute fréquence les éléphants de mer sont devenus des bio-échantillonneurs incontournables pour évaluer l’influence des conditions océanographiques sur la structuration fine échelle des différents niveaux biologiques dans l’Océan Austral.

28/03/2019/by titodemora

Christophe Guinet nous présentera ses travaux sur les éléphants de mer en tant que bio-échantillonneurs des océans.

Séminaire de Miguel A. Tripp-Valdez le 4 mars à 11h

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Miguel A. Tripp-Valdez présentera ses travaux de recherche lors d’un séminaire le lundi 4 mars à 11h en salle A215.

Effects of hypoxia and hypercapnia on thermal tolerance: an integrative assessment on the green abalone (Haliotis fulgens)

Miguel a travaillé durant son doctorat au CIBNOR (Mexique) sur la tolérance thermique et la réponse métabolique et moléculaire de l’ormeau vert (Haliotis fulgens) dans des conditions d’hypoxie et d’hypercapnie. Il est présent au LEMAR dans le cadre du montage d’un projet de post-doctorat.

25/02/2019/by schaal

Effects of hypoxia and hypercapnia on thermal tolerance: an integrative assessment on the green abalone (Haliotis fulgens)