Cantharella

Base de données pharmacochimique des substances naturelles

Coordination

Sylvain Petek

Type de projet

National

International

Financement

IRD

Dept OCEANS et SAS

2025: LEMAR, Plateforme Lipidocéan, Projets: ANR HABIS, ANR Save-C, CGO MEREOS (Région Bretagne)

Durée du projet

Début du projet

11/10/2010

Fin du projet

Liens

Un outils dédié à l’étude des substances naturelles

Cet outil de travail collaboratif accessible via internet de manière sécurisée, est dédié aux travaux sur les substances naturelles quelle qu’en soit l’origine.

Il permet de capitaliser, pérenniser et partager de manière contrôlée les données (de la récolte, aux molécules isolées, en passant par les tests biologiques, les procédés d’extraction et de purification) entre collaborateurs d’un projet, mais également d’effectuer une restitution auprès des territoires et pays d’où proviennent les organismes étudiés dans le cadre de la démarche d’APA (Accès et Partage des Avantages).

Le logiciel « dockerisé » est diffusé gratuitement sous licence libre (HAL-01887126) et s’installe sur un serveur (via votre service informatique ou un prestataire cf. Code Lutin).

Dernière version à tester ICI

Nouvelle version de 2025

Développements : Code Lutin

Financements : PharmaDev (via IRD dept SAS), LEMAR (via IRD dept OCEANS) , Plateforme Lipidocéan

Projets ANR HABIS, ANR Save-C, CGO MEREOS (Région Bretagne)

Nouvelles fonctionnalités :

Un module dédié aux Connaissances traditionnelles (développé en lien avec les collègues de PharmaDev)
- pour enregistrer les remèdes utilisés en médecine traditionnelle
Un module dédié aux Dosages (développé en lien avec les collègues de la plateforme Lipidocéan)
- pour enregistrer les dosages d’éléments, de composés (saisie libre) ou de molécules présentes dans la BDD
Un module de personnalisation de l’instance, permettant à l’administrateur de l’instance :
- d’ajouter le logo de son laboratoire ou de son équipe
- de modifier le message d’accueil
- de modifier les mentions légales
- de gérer la taille des documents admis
Un module de sauvegarde de la base de données :
- permet à l’administrateur de l’instance de réaliser facilement la sauvegarde de la BDD
Une amélioration de la gestion des droits :
- Pour l’administrateur d’un projet (ou campagne), droit en écriture sur les données liées à son projet
Une amélioration de l’utilisation :
- Suppression de la restriction du format des fichiers joints

Améliorations apportées par la version de 2022

Développements : Code Lutin, financement IRD dept OCEANS

Nouvelles fonctionnalités :

Des systèmes d’information géographique (SIG) au niveau de différentes interfaces
Une interface de recherche plus élaborée, permettant :
- d’effectuer une recherche sur les données et les documents
- d’effectuer des recherches en combinant plusieurs paramètres (pays, zone géographique (à partir de la carte), type de documents)
- de visualiser les stations et les échantillons sur la carte
- d’accéder plus facilement aux documents
Des modules d’import de données au niveau de toutes les interfaces
- La saisie des données étant le principal frein à l’utilisation/alimentation des bases de données, ces modules facilitent grandement les choses
Des modules d’export aux formats:
- CSV : pour les tableaux de données
- ZIP : pour les documents au niveau de l’interface recherche
- PNG : pour exporter les cartes au format image
- KML et GeoJSON : pour exporter les points GPS à partir des cartes
Une amélioration de la gestion des droits :
- Possibilité pour le créateur d’une campagne (ou projet) de gérer les droits d’accès
- Possibilité pour le créateur d’une campagne de déléguer la gestion des droits d’accès à un « Administrateur de campagne »
- Pour une campagne, visualisation et attribution des droits d’accès rassemblés au niveau de la fiche campagne

Citation: Sylvain Petek, Adrien Cheype, Mickael Tricot, Alban Diguer, Benjamin Poussin, et al.. Cantharella: Pharmacochemical database of natural products. 2025, hal-01887126v3