Emma MICHAUD

Carbone / flux biogéochimiques / Bioturbation / Ecologie fonctionnelle / biodiversité benthique / mangroves / Ecosystèmes côtiers

Chargée de Recherches, HDR
CNRS

Affectation

Laboratoire LEMAR

DISCOVERY

Contact

Parcours: Je suis chargée de recherches au CNRS, après avoir effectué une thèse de Doctorat en Océanographie en cotutelle entre le Canada (ISMER-UQAR) et la France (AMU-MIO), et deux post-doctorats, l’un aux Etats-Unis (Stony Brook University, School of Marine and Atmospheric Sciences) et l’autre en France (Université de Bretagne Occidentale).

Thématique de recherche: Mes recherches ambitionnent de comprendre et prédire les effets du changement global sur l’érosion de la biodiversité benthique et ses conséquences sur le fonctionnement biogéochimique des zones côtières. Dans ce cadre, mes travaux se concentrent sur le devenir du carbone sédimentaire des écosystèmes côtiers sous l’effet des activités biologiques des invertébrés benthiques, regroupées sous le terme de « bioturbation », dans un contexte de réchauffement climatique et de forte anthropisation. Je travaille dans les milieux côtiers stockant d’importantes quantités de carbone dans leurs sédiments en milieux tempérés, polaires et tropicaux (mangroves, estuaires, fjords, vasières) où les activités de bioturbation modifient son devenir (i.e., enfouissement, dégradation, reminéralisation…), par les modifications physico-chimiques du sédiment qu’elles induisent. Ces travaux s’articulent autour de deux axes :
– Axe 1 : Caractérisation de la biodiversité benthique et des activités de bioturbation des écosystèmes côtiers (écologie fonctionnelle)
– Axe 2 : Impact des changements de bioturbation sur le fonctionnement biogéochimique côtier (diagenèse précoce et flux biogéochimiques eau-air-sédiment)
J’aborde mes questions scientifiques par une triple approche couplant expérimentation (microcosmes en laboratoires, mésocosmes in situ) / observation (campagnes de mesures et d’échantillonnage sur le terrain) / modélisation (modèles diagénétiques).
J’utilise des technologies de pointe pour l’analyse et l’observation 2D ou 3D de la matrice sédimentaire (Optodes planaires, Rayons X, Drone, photogrammétrie, télédétection…), en collaboration étroite avec des collègues chimistes, physiciens et ingénieurs, afin d’intégrer dans mes travaux l’hétérogénéité spatiale des milieux étudiés, de la micro à la macro-échelle.

Responsabilités collectives locales :
Co-Responsable de l’équipe « DISCOVERY » du LEMAR, 2022-2026 (60 personnes, 4 tutelles)
Co-Responsable du thème 3 « Durabilité des systèmes côtiers » de l’EUR-ISBLUE, 2022-2026
Co-animatrice de l’axe transverse « LEMAR au SUD », 2016-présent

Responsabilités collectives à l’échelle nationale et internationale:
Directrice du GDR 2162 – Mangroves (Réseau thématique Mangroves à l’anthropocène: enjeux de gestion de socio-écosystèmes menacés face aux changement globaux) – Réseau de 30 UMRs, 60 participants (2024−2028)
Co-directrice du GDR LIGA 3586 (Littoral de Guyane sous influence amazonienne) – Réseau de 30 UMRs, 110 participants (2018-2022)
Responsable de la 1ere école thématique internationale «Bioturbation 2022″ dans le cadre de l’association internationale du Nereis Park

Encadrement de post-doctorants
2023-2025, Romain Gougeon “L’ingénierie des écosystèmes du Paléozoïque : l’analyse des traces fossiles et des proxys de l’écologie marine permet de comprendre l’évolution du comportement animal au cours de l’évolution. » (Co-encadrement avec M. Vidal (Geo-Ocean) et Univ. Saskatchewan, Canada).
2018-2019, Guillaume Brunier, « Biogéomorphologie des vasières de Guyane »
2016-2018, Nathalie Morata, « Approche de biomarqueurs multiples pour évaluer l’impact de la production primaire sur les communautés benthiques de l’Arctique » (Co-encadrement avec P. Renaud, AkvaPlan NIva, Norvège).
2015-2017, Raghab Ray « Origine, transport et devenir du carbone organique dans la forêt de mangrove sur les côtes guyanaises » (Co-encadrement avec G. Thouzeau).

Encadrement de thèses:
2024-2027, Guerric Barrière « Structure des populations de crabes brachyoures dans les mangroves de l’Atlantique sud-américain le long d’un gradient latitudinal” (Co-direction avec M. Tavares (Brésil, USP) et G. Charrier (UBO)).
2020-2023, Adriana Spedicato « Rôle des forçages environnementaux dans la distribution spatiale de la méiofaune et des nématodes dans les mangroves des Outre-Mer Français (Guyane, Guadeloupe, Martinique et Mayotte) ». (Co-direction avec G. Thouzeau et D. Zeppilli).
2012-2016, Adélaide Aschenbroich « Biodiversité et fonctionnement des communautés benthiques de la mangrove de Guyane Française » (Co-direction avec G. Thouzeau et F. Fromard).
2009-2011, Mélanie Raimonet «Cycle benthique du silicium dans les estuaires : observations et modélisation à différentes échelles spatio-temporelles » (Co-encadrement avec L. Memery et O. Ragueneau).

355235 ACL michaud 1 apa 50 date desc 1 Michaud, E. 185434 https://www-iuem.univ-brest.fr/lemar/wp-content/plugins/zotpress/
Militon, C., Michaud, E., Sylvi, L., Ferriz, L. M., Roic, E., Gilbert, F., Jezequel, R., & Cuny, P. (2024). In situ oil contamination in young mangroves: Biodegradation of petroleum hydrocarbons and effects on the microbial and benthic communities, an experimental study in French Guiana. MARINE POLLUTION BULLETIN, 209, 117285. https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2024.117285 Cite
Michaud, E., Aschenbroich, A., Stieglitz, T., Brunier, G., Aller, R. C., Anthony, E., Fromard, F., & Thouzeau, G. (2024). Upscaling the contribution of crab burrows to mangrove ecosystem functioning in French Guiana (South America). REGIONAL ENVIRONMENTAL CHANGE, 24(4), 165. https://doi.org/10.1007/s10113-024-02319-z Cite
Aller, R., Klingensmith, I., Stieglitz, T., Heilbrun, C., Waugh, S., Aschenbroich, A., Thouzeau, G., & Michaud, E. (2024). Biogeochemical plumbing of pioneer mangrove intertidal flats in French Guiana. REGIONAL ENVIRONMENTAL CHANGE, 24(3), 117. https://doi.org/10.1007/s10113-024-02272-x Cite
Spedicato, A., Zeppilli, D., Thouzeau, G., Cuny, P., Militon, C., Hubas, C., Sylvi, L., Dirberg, G., Jezequel, R., Barriere, G., Michel, L. N., Bezerra, T. N., & Michaud, E. (2024). Deciphering environmental forcings in the distribution of meiofauna and nematodes in mangroves of the Atlantic-Caribbean-East Pacific and Indo-West Pacific regions. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 930, 172612. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.172612 Cite
Fiard, M., Militon, C., Sylvi, L., Migeot, J., Michaud, E., Jezequel, R., Gilbert, F., Bihannic, I., Devesa, J., Dirberg, G., & Cuny, P. (2024). Uncovering potential mangrove microbial bioindicators to assess urban and agricultural pressures on Martinique island in the eastern Caribbean Sea. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 928, 172217. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.172217 Cite
Cepeda, D., Sanchez, N., Spedicato, A., Michaud, E., & Zeppilli, D. (2024). Environmental drivers modelling the mangrove Kinorhyncha community along an urban-to-natural gradient in French Guiana (western Atlantic Ocean). FRONTIERS IN MARINE SCIENCE, 11, 1342763. https://doi.org/10.3389/fmars.2024.1342763 Cite
Raimonet, M., Ragueneau, O., Soetaert, K., Khalil, K., Leynaert, A., Michaud, E., Moriceau, B., Rabouille, C., & Memery, L. (2023). Benthic contribution to seasonal silica budgets in two macrotidal estuaries in North-Western France. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE, 10, 1269142. https://doi.org/10.3389/fmars.2023.1269142 Cite
Serafim, T. S. G., de Almeida, M. G., Thouzeau, G., Michaud, E., Niggemann, J., Dittmar, T., Seidel, M., & de Rezende, C. E. (2023). Land-use changes in Amazon and Atlantic rainforests modify organic matter and black carbon compositions transported from land to the coastal ocean. Science of the Total Environment, 878, 162917. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.162917 Cite
Spedicato, A., Zeppilli, D., Thouzeau, G., & Michaud, E. (2023). Nematode diversity patterns in mangroves: a review of environmental drivers at different spatial scales. Biodiversity and Conservation. https://doi.org/10.1007/s10531-023-02562-6 Cite
Cepeda, D., Gonzalez-Casarrubios, A., Sanchez, N., Spedicato, A., Michaud, E., & Zeppilli, D. (2022). Two new species of mud dragons (Scalidophora: Kinorhyncha) inhabiting a human-impacted mangrove from Mayotte (Southwestern Indian Ocean). Zoologischer Anzeiger, 301, 23–41. https://doi.org/10.1016/j.jcz.2022.09.001 Cite
Cepeda, D., Gayet, N., Spedicato, A., Michaud, E., & Zeppilli, D. (2022). Two new species of the Echinoderes coulli-group (Kinorhyncha: Cyclorhagida: Echinoderidae) from a low human-impacted mangrove swamp in French Guiana (western Atlantic Ocean). Zoologischer Anzeiger, 301, 179–195. https://doi.org/10.1016/j.jcz.2022.10.008 Cite
Michaud, E., Aschenbroich, A., Gauthier, O., Fromard, F., Aller, J. Y., Aller, R. C., Brunier, G., Anthony, E. J., Gardel, A., Le Garrec, V., Leynaert, A., & Thouzeau, G. (2022). The Codevelopment of Mangroves and Infaunal Community Diversity in Response to the Natural Dynamics of Mud Deposition in French Guiana. Sustainability, 14(5), 2829. https://doi.org/10.3390/su14052829 Cite
Fiard, M., Cuny, P., Sylvi, L., Hubas, C., Jezequel, R., Lamy, D., Walcker, R., El Houssainy, A., Heimburger-Boavida, L.-E., Robinet, T., Bihannic, I., Gilbert, F., Michaud, E., Dirberg, G., & Militon, C. (2022). Mangrove microbiota along the urban-to-rural gradient of the Cayenne estuary (French Guiana, South America): Drivers and potential bioindicators. Science of the Total Environment, 807, 150667. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.150667 Cite
Jaud, M., Sicot, G., Brunier, G., Michaud, E., Le Dantec, N., Ammann, J., Grandjean, P., Launeau, P., Thouzeau, G., Fleury, J., & Delacourt, C. (2021). Easily Implemented Methods of Radiometric Corrections for Hyperspectral-UAV-Application to Guianese Equatorial Mudbanks Colonized by Pioneer Mangroves. Remote Sensing, 13(23), 4792. https://doi.org/10.3390/rs13234792 Cite
Michaud, E., Aller, R. C., Zhu, Q., Heilbrun, C., & Stora, G. (2021). Density and size-dependent bioturbation effects of the infaunal polychaete Nephtys incisa on sediment biogeochemistry and solute exchange. Journal of Marine Research, 79(4), 181–220. https://doi.org/10.1357/002224021834670801 Cite
Gilbert, F., Kristensen, E., Aller, R. C., Banta, G. T., Archambault, P., Belley, R., Bellucci, L. G., Calder, L., Cuny, P., de Montaudouin, X., Eriksson, S. P., Forster, S., Gillet, P., Godbold, J. A., Glud, R. N., Gunnarsson, J., Hulth, S., Lindqvist, S., Maire, A., … Stora, G. (2021). Sediment reworking by the burrowing polychaete Hediste diversicolor modulated by environmental and biological factors across the temperate North Atlantic. A tribute to Gaston Desrosiers. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 541, 151588. HAL. https://doi.org/10.1016/j.jembe.2021.151588 Cite
Michelet, C., Zeppilli, D., Hubas, C., Baldrighi, E., Cuny, P., Dirberg, G., Militon, C., Walcker, R., Lamy, D., Jézéquel, R., Receveur, J., Gilbert, F., Houssainy, A. E., Dufour, A., Heimbürger-Boavida, L.-E., Bihannic, I., Sylvi, L., Vivier, B., & Michaud, E. (2021). First Assessment of the Benthic Meiofauna Sensitivity to Low Human-Impacted Mangroves in French Guiana. Forests, 12(3), 338. https://doi.org/10.3390/f12030338 Cite
Dirberg, G., Barnaud, G., Brivois, O., Caessteker, P., Cormier-Salem, M. C., Cuny, P., Fiard, M., Fromard, F., Gilbert, F., Grouard, S., Guiral, D., Hubas, C., Imbert, D., Lamy, D., Meziane, T., Michaud, E., Michelet, C., Militon, C., Pibot, A., … Monnier, O. (2020). Towards the Development of Ecosystem-Based Indicators of Mangroves Functioning State in the Context of the Eu Water Framework Directive. Vie Et Milieu-Life and Environment, 70(3–4), 303–310. https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000675537200029 Cite
Cuny, P., Jezequel, R., Michaud, E., Sylvi, L., Gilbert, F., Fiard, M., Chevalier, C., Morel, V., & Militon, C. (2020). Oil Spill Response in Mangroves: Why a Specific Ecosystem-Based Management Is Required? The Case of French Guiana - a Mini-Review. Vie Et Milieu-Life and Environment, 70(3–4), 69–76. https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000675537200008 Cite
Morata, N., Michaud, E., Poullaouec, M.-A., Devesa, J., Le Goff, M., Corvaisier, R., & Renaud, P. E. (2020). Climate change and diminishing seasonality in Arctic benthic processes. Philosophical Transactions of the Royal Society A-Mathematical Physical and Engineering Sciences, 378(2181), 20190369. https://doi.org/10.1098/rsta.2019.0369 Cite
Ray, R., Thouzeau, G., Walcker, R., Vantrepotte, V., Gleixner, G., Morvan, S., Devesa, J., & Michaud, E. (2020). Mangrove-Derived Organic and Inorganic Carbon Exchanges Between the Sinnamary Estuarine System (French Guiana, South America) and Atlantic Ocean. Journal of Geophysical Research-Biogeosciences, 125(8), e2020JG005739. https://doi.org/10.1029/2020JG005739 Cite
Baldrighi, E., Dovgal, I., Zeppilli, D., Abibulaeva, A., Michelet, C., Michaud, E., Franzo, A., Grassi, E., Cesaroni, L., Guidi, L., Balsamo, M., Sandulli, R., & Semprucci, F. (2020). The Cost for Biodiversity: Records of Ciliate-Nematode Epibiosis with the Description of Three New Suctorian Species. Diversity-Basel, 12(6), 224. https://archimer.ifremer.fr/doc/00632/74417/. https://doi.org/10.3390/d12060224 Cite
Brunier, G., Michaud, E., Fleury, J., Anthony, E. J., Morvan, S., & Gardel, A. (2020). Assessing the relationship between macro-faunal burrowing activity and mudflat geomorphology from UAV-based Structure-from-Motion photogrammetry. Remote Sensing of Environment, 241, 111717. https://doi.org/10.1016/j.rse.2020.111717 Cite
Oleszczuk, B., Michaud, E., Morata, N., Renaud, P. E., & Kedra, M. (2019). Benthic macrofaunal bioturbation activities from shelf to deep basin in spring to summer transition in the Arctic Ocean. Marine Environmental Research, 150, UNSP 104746. https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2019.06.008 Cite
Ray, R., Michaud, E., Aller, R. C., Vantrepotte, V., Gleixner, G., Walcker, R., Devesa, J., Le Goff, M., Morvan, S., & Thouzeau, G. (2018). The sources and distribution of carbon (DOC, POC, DIC) in a mangrove dominated estuary (French Guiana, South America). Biogeochemistry, 138(3), 297–321. https://doi.org/10.1007/s10533-018-0447-9 Cite
Aschenbroich, A., Michaud, E., Gilbert, F., Fromard, F., Alt, A., Le Garrec, V., Bihannic, I., De Coninck, A., & Thouzeau, G. (2017). Bioturbation functional roles associated with mangrove development in French Guiana, South America. Hydrobiologia, 794(1), 179–202. https://doi.org/10.1007/s10750-017-3093-7 Cite
Aschenbroich, A., Michaud, E., Stieglitz, T., Fromard, F., Gardel, A., Tavares, M., & Thouzeau, G. (2016). Brachyuran crab community structure and associated sediment reworking activities in pioneer and young mangroves of French Guiana, South America. Estuarine Coastal and Shelf Science, 182, 60–71. https://doi.org/10.1016/j.ecss.2016.09.003 Cite
Brunier, G., Fleury, J., Anthony, E. J., Pothin, V., Vella, C., Dussouillez, P., Gardel, A., & Michaud, E. (2016). Structure-from-Motion photogrammetry for high-resolution coastal and fluvial geomorphic surveys. Géomorphologie : Relief, Processus, Environnement, 22(2), 147–161. https://doi.org/10.4000/geomorphologie.11358 Cite
Berge, J., Daase, M., Renaud, P. E., Ambrose, W. G., Darnis, G., Last, K. S., Leu, E., Cohen, J. H., Johnsen, G., Moline, M. A., Cottier, F., Varpe, O., Shunatova, N., Balazy, P., Morata, N., Massabuau, J.-C., Falk-Petersen, S., Kosobokova, K., Hoppe, C. J. M., … Callesen, T. A. (2015). Unexpected Levels of Biological Activity during the Polar Night Offer New Perspectives on a Warming Arctic. Current Biology, 25(19), 2555–2561. https://doi.org/10.1016/j.cub.2015.08.024 Cite
Morata, N., Michaud, E., & Wlodarska-Kowalczuk, M. (2015). Impact of early food input on the Arctic benthos activities during the polar night. Polar Biology, 38(1), 99–114. https://doi.org/10.1007/s00300-013-1414-5 Cite
Raimonet, M., Andrieux-Loyer, F., Ragueneau, O., Michaud, E., Kérouel, R., Philippon, X., Nonent, M., & Mémery, L. (2013). Strong gradient of benthic biogeochemical processes along a macrotidal temperate estuary: focus on P and Si cycles. Biogeochemistry, 115(1–3), 399–417. http://link.springer.com/article/10.1007/s10533-013-9843-3 Cite
Michaud, E., Aller, R. C., & Stora, G. (2010). Sedimentary organic matter distributions, burrowing activity, and biogeochemical cycling: natural patterns and experimental artifacts. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 90(1), 21–34. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0272771410002799 Cite

 

Autres publications avant 2010

Michaud, E., G. Desrosiers, R. Aller, F. Mermillod-Blondin, B. Sundby, G. Stora. 2009. Spatial interactions in the Macoma balthica community control biogeochemical fluxes at the sediment-water interface and microbial abundances. J. Mar. Res. 61, 1, 43-70. https://doi.org/10.1357/002224009788597926

Gilbert F., Hulth S., Grossi V., Poggiale J-C., Desrosiers G., Rosenberg R., Gérino M., François-Carcaillet F., Michaud E., Stora G. 2007. Sediment reworking activity rates and patterns in some marine benthic species from the Gullmar Fjord (Western Sweden). Importance of faunal biovolume. JEMBE, 348, 1-2, 133-144. https://doi.org/10.1016/j.jembe.2007.04.015

Michaud, E., G. Desrosiers, F. Mermillod-Blondin, B. Sundby, G. Stora. 2006. The functional group approach to bioturbation: II. The effects of the M. balthica community on fluxes of nutrients and dissolved organic carbon across the sediment-water interface. JEMBE, 337: 178-189. https://doi.org/10.1016/j.jembe.2006.06.025

Michaud, E., G. Desrosiers, F. Mermillod-Blondin, B. Sundby, G. Stora. 2005. The functional group approach to bioturbation: The effects of biodiffusers and gallery-diffusers of the M. balthica community on sediment oxygen uptake. JEMBE, Vol. 326, 77-88. https://doi.org/10.1016/j.jembe.2005.05.016

Mermillod-Blondin, S. Marie, G. Desrosiers, B. Long, L. de Montety, E. Michaud, G. Stora. 2003. Assessment of the spatial variability of intertidal benthic communities by axial tomodensitometry: importance of fine-scale heterogeneity. JEMBE, Vol. 287, 193-208. https://doi.org/10.1016/S0022-0981(02)00548-8

Solan, J.D. Germano, D.C. Rhoads, C. Smith, E. Michaud, D. Parry, F. Wenzhöfer, B. Kennedy, C. Henriques, E. Battle, D. Carey, L. Iocco, R. Valente, J. Watson and R. Rosenberg. 2003. Towards a greater understanding of pattern, scale and process in marine benthic systems: a picture is worth a thousand worms. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. Vol. 285-286, 313-339. https://doi.org/10.1016/S0022-0981(02)00535-X

Michaud, E., G. Desrosiers, B. Long, L. de Montety, J.F. Crémer, E. Pelletier, J. Locat, F. Gilbert, G. Stora. 2003. Use of axial tomography to follow temporal changes of benthic communities in an unstable sedimentary environment (Ha!Ha! Bay, Saguenay Fjord). J. Exp. Mar. Biol. Ecol.Vol. 285-286, 265-282. https://doi.org/10.1016/S0022-0981(02)00532-4

Desrosiers, G., Gonon, M., de Montety, L., Pelletier, É., Nozais, C., Michaud, E., Stora, G., Long, B., Tremblay, H., Locat, J. 2nd International Symposium on Contaminated Sediments. Québec, Canada, 26-28 mai. Editeur : H. Tremblay, J. Locat, R. Galvez-Cloutier. pp. 78-82

Michaud, E., B. Long, J.F. Crémer, G. Desrosiers, L. de Montety. 2001. Les phases de construction deltaïques, influence d’un apport catastrophique. Canadian Coastal Conference, Quebec, Proceedings. Québec, 16-19 mai. Éditeur : B.F. Long. pp. 533-547.

 

Livres:

E. Michaud, A. Aschenbroich, G. Thouzeau. « La mangrove, l’incontournable du littoral guyanais » in A. Gardel & D. Davy (sous la direction de), Oyapock et Maroni. Portraits d’estuaires amazoniens, Paris, éditions Quæ, Paru le 25 mars 2021. 142 p. ISBN 2759232743

Mangrove, une forêt dans la mer. in F. Fromard, E. Michaud, M. Hossaert-McKey (sous la direction de), Eds Cherche-Midi. Paru le 2 février 2018. 167 p. ISBN 978-2-7491-5764-1

 

Participation aux projets de recherche