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Stagiaire en biologie marine

Caractériser la capacité du bar Dicentrarchus labrax à synthétiser les oméga-3 LC en fonction de son stade ontogénétique et de son habitat.

Les acides gras polyinsaturés oméga-3 à longue chaîne (oméga-3 LC) sont des composants majeurs des membranes cellulaires de tous les organismes, y compris les humains, leur conférant un rôle vital dans le maintien des fonctions physiologiques. Leurs effets bénéfiques ont été largement démontrés chez l’Homme, et leur consommation hebdomadaire est aujourd'hui recommandée par de nombreuses autorités (FDA, AFSSA...).
Les oméga-3 LC sont produits à la base de la chaîne alimentaire, c'est-à-dire par les microalgues marines et en particulier les diatomées. Cette production détermine la disponibilité de ces nutriments pour les niveaux trophiques supérieurs, comme les poissons marins qui présentent de faibles capacités à les synthétiser. Les poissons représentent l'un des principaux vecteurs dans le transfert d'oméga-3 LC de l'écosystème aquatique vers l'homme.
Le changement global, par le réchauffement, l'acidification ou l'hypoxie des eaux, entraîne une réduction globale de la production d'oméga-3 LC à la base du réseau trophique marin, en modifiant les assemblages d'espèces de microalgues et leur physiologie. Une telle diminution devrait entraîner une variabilité de la composition en oméga-3 LC des membranes chez les organismes des niveaux trophiques supérieurs tels que les poissons. De plus, il a été démontré chez les ectothermes que l'élévation de la température interagit négativement avec la diminution de la disponibilité trophique en oméga-3 LC sur la composition des membranes des poissons.
De tels changements dans la composition des membranes chez les poissons peuvent avoir des répercussions physiologiques majeures (croissance, reproduction) avec des conséquences à plus grande échelle (dynamique des populations, fonctionnement des écosystèmes, diminution possible de la disponibilité de ces nutriments pour le bien-être humain).
Cette chaîne de conséquences demeure peu étudiée, mais soulève la question de savoir comment les poissons pourraient s’ajuster physiologiquement aux changements environnementaux en cours ?
Les poissons marins, qui vivent dans un environnement trophique riche en oméga-3 LC (riches en diatomées), ont une très faible capacité de synthèse de ces molécules (< 5%) qui sont fournies par leur alimentation. Par contre, les poissons d'eau douce, qui sont exposés à un environnement trophique plus pauvre en oméga-3 LC (peu de diatomées), ont conservé la capacité de les synthétiser (~ 25% des oméga-3 LC) à partir des précurseurs présents dans leur alimentation. La capacité des poissons euryhalins, comme le bar européen Dicentrarchus labrax, à activer ou désactiver ces mécanismes de synthèse en fonction du type d'habitat dans lequel ils se trouvent (marin, saumâtre, fluvial) reste mal comprise, de même que le coût énergétique associé à ce type de modulation.
Dans ce contexte, le projet Emergence ADjUST financé par l’EUR ISBLue dans lequel s’inscrit ce stage sont de :
- (1) Mesurer in situ la capacité du bar à synthétiser des omega-3 LC dans différents habitats et à différents stades ontogénétiques,
- (2) Évaluer la plasticité de ses capacités naturelles de synthèse en mesurant expérimentalement leur régulation lorsque les poissons sont exposés à une diminution de la disponibilité des oméga 3 LC couplée à augmentation de température
- (3) Évaluer au niveau individuel le coût énergétique de la mise en œuvre de ses voies de synthèse.

Dans ce contexte, l’objectif du stage est de se focaliser sur le premier objectif du projet ADjUST. Dans le cadre de la campagne de pêche prévue au sein du projet européen FEAMP Nourdem (Nourriceries à Demerseaux), des individus des stades G0 à G3 ont été échantillonnés durant l’été 2019 le long de trois estuaires français (d'amont en aval) selon un gradient Nord-Sud (Gironde, Loire et Seine). L’objectif du stage est de caractériser, en milieu naturel et selon une approche multi-sites, la capacité des poissons à synthétiser les oméga-3 LC par la mesure (1) de l'expression de gènes d’intérêt codant pour les voies de synthèse des oméga-3 LC, (2) et de la teneur en oméga-3 LC dans le foie.

Le travail de stage consistera en :
- La mesure de l’expression de gènes d’intérêt impliqué dans les voies de synthèse des oméga 3 LC
- la finalisation des analyses lipidiques initiées sur le foie (analyse de la composition en acides gras des lipides membranaires et des lipides de réserve) par chromatographie en phase gazeuse (plateforme d’analyse des lipides marins LIPIDOCEAN située à l’IUEM)
- l’analyse et l’interprétation des données obtenues
- la rédaction d’un rapport.
- la préparation d’une soutenance orale

Formation en biologie/ physiologie des organismes (marins) ; bonne dynamique d’ouverture et de communication ; rigueur, autonomie, bonnes capacités rédactionnelles en français et anglais

en fonction de la formation (environ 6 mois)

Centre Ifremer Plouzané, ZI pointe du diable et Institut Européen de la mer, place Nicolas Copernic, 29280 Plouzané

sur la base officielle : ~ 580 € par mois

Envoyer un CV et lettre de motivation à Marie Vagner,Fabienne Le Grand , David Mazurais avant le 31 octobre 2019

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